Cốt truyện xảy ra vào 10 năm sau của Yu-Gi-Oh phần đầu. Lúc này Yugi Muto đã trở thành một tượng đài bất diệt trong làng bài ma thuật. Nhân vật chính của series là Yuki Judai, một thiếu niên đam mê bài ma thuật quyết tâm trở thành Vua đấu bài. Cậu tham dự kỳ thi tuyển vào học viện đào tạo bài thủ Duel Academy và được xếp vào nhà Osiris Red.
Because of the legend left by Tatsuya Uesugi, Meisei Academy High School was well-known for their strong baseball team. But 26 years after their glory, the team has not been able to keep their record and has since lost their fame.
Một bộ anime truyền hình mới cho kỷ niệm 20 năm nhượng quyền anime. Câu chuyện diễn ra trong tương lai tại thị trấn Gouha. Yuuga Oudou, một học sinh lớp năm, yêu thích cả phát minh và đấu tay đôi. Luke, bạn cùng lớp của anh ấy là một "đấu sĩ số một tự phong tại trường tiểu học Gouha 7"
A Tank with a Rare 9999 Resistance Skill Got Kicked from the Heros Party. Rud là một chiếc xe tăng của bữa tiệc của anh hùng và được cho là có sự bảo vệ cao nhất từ trước đến nay trong lịch sử.
Not far from the town of Domina lives Shiloh, a boy who keeps hearing a voice in his dreams about a mission he must fulfill. But what mission could he be needed for remains unknown.