Hai năm đã trôi qua, kể từ khi Cloud sử dụng năng lượng “Dòng sinh mệnh” để ngăn chặn sự huỷ diệt của Jenova, cả hành tinh tưởng chừng chỉ toàn những màu xanh của cây cối.
đưa bạn đến với học viện Mihama vốn dĩ được tổ chức chống khủng bố CIRS của Mẽo và Nhật dựng lên với tiêu chí Đào tạo chuyên gia cho thế hệ sau này. Vẫn theo công thức cũ của series Grisaia của FrontWing
Năm 100 của thời đại Taisho. Sau vụ nổ thảm họa xảy ra 16 năm trước, gần như cả Thủ Đô Tokyo đã bị phá hủy đồng thời chôn vùi cả nền “Kỹ thuật hơi nước”. Thủ Đô hiện tại đã được tái tạo nhờ một loại năng lượng mới dựa trên sức mạnh tâm linh, "Mirai."
Một năm đã trôi qua kể từ sự kiện SSSS.Gridman. Thế giới hòa bình và không ai ngoại trừ Rikka và Utsumi nhớ đến kaiju, Gridman hay Akane Shinjou.
Sống trong khu nhà ninja nằm ở góc thành phố tương lai, Rikka, trưởng nữ của một gia tộc Ninja, cha cô thì là một nhà nghiên cứu. Tiếp tục với cuộc sống quá đỗi hằng ngày và bình thường thì một hôm, căn nhà của Rikka đã đột nhiên bị tấn công. Bị dồn vào một góc, cô sẽ làm gì để vượt qua cuộc khủng hoảng này? Xé tan bóng tối thành từng mảnh và trở thành "BLACK"?